sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-BR-7703-a	1	61735	17360325	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	17360532	17454803	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	17456934	50083857	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	50086466	50837434	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	50838269	54764639	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	54768847	55050064	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	55052794	66919601	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	66920521	72242514	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	72242858	76412621	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	76413384	76608556	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	76612646	115774357	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	115779914	116257579	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	116260109	118101807	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	118107217	118837324	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	118837890	211873105	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	211873368	212534273	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	212535029	215593426	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	215597498	215800210	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	215805046	241580784	1	1
TCGA-BR-7703-a	1	241586760	241990131	1	0
TCGA-BR-7703-a	1	241995035	248930189	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	12784	30750136	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	30750959	30781499	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	30782310	75049302	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	75049603	75859783	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	75860019	83409931	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	83410946	83991167	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	83992044	149584747	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	149589569	150499012	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	150503569	180863412	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	180865447	181545964	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	181546719	212214023	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	212214063	213409182	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	213412835	217185942	1	1
TCGA-BR-7703-a	2	217186104	217399581	1	0
TCGA-BR-7703-a	2	217400602	242147305	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	18667	38607330	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	38611228	38828684	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	38828854	85825369	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	85830464	86181142	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	86185713	109284392	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	109284992	109603872	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	109605398	126882330	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	126889380	126942240	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	126942356	130202376	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	130210782	130278257	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	130280331	145501295	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	145508858	145577555	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	145577932	152872973	1	1
TCGA-BR-7703-a	3	152873032	173311986	1	0
TCGA-BR-7703-a	3	173312083	198169247	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	12281	200358	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	204157	2622376	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	2622481	97788779	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	97793172	98376102	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	98377828	109275839	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	109277104	110226507	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	110227174	126792349	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	126792478	126952797	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	126952824	145709979	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	145710255	146079262	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	146080097	183171730	1	1
TCGA-BR-7703-a	4	183173607	183695626	1	0
TCGA-BR-7703-a	4	183706657	190106768	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	15532	44257369	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	44258414	44393467	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	44394493	51288970	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	51294172	51642991	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	51643117	106090632	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	106091397	106326053	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	106327798	160636373	1	1
TCGA-BR-7703-a	5	160639659	160986710	1	0
TCGA-BR-7703-a	5	160986816	181363319	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	149661	6253313	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	6254470	6356465	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	6357252	28091915	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	28091956	30759162	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	30760583	55800317	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	55801216	55889135	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	55889518	104392612	1	1
TCGA-BR-7703-a	6	104394890	105276766	1	0
TCGA-BR-7703-a	6	105278161	170741917	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	43259	36157347	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	36158299	36355685	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	36358419	52363996	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	52364846	52762462	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	52763164	56847024	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	56847094	57690658	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	57693770	68067966	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	68070177	68425724	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	68426713	69164425	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	69164674	70211079	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	70214695	88363451	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	88367905	88708091	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	88710834	101690667	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	101697966	102261035	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	102261079	124502156	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	124506449	124558603	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	124558831	134505081	1	1
TCGA-BR-7703-a	7	134508079	134794023	1	0
TCGA-BR-7703-a	7	134795836	159334314	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	81254	18003847	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	18006508	18922916	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	18927673	39796464	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	39800700	40583080	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	40583260	63560419	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	63561612	64077973	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	64082932	75870073	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	75880592	78122698	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	78124542	108086916	1	1
TCGA-BR-7703-a	8	108090071	108234583	1	0
TCGA-BR-7703-a	8	108238376	145072769	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	46587	5454734	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	5454967	5639823	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	5644555	69401235	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	69401654	70083123	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	70083182	88915407	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	88915582	89628279	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	89628484	125865036	1	1
TCGA-BR-7703-a	9	125868232	126651019	1	0
TCGA-BR-7703-a	9	126653934	138200944	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	26823	15582942	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	15589352	16086634	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	16090653	28363588	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	28363643	28951653	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	28951825	56460920	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	56462349	57267513	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	57267691	123952811	1	1
TCGA-BR-7703-a	10	123966087	124428645	1	0
TCGA-BR-7703-a	10	124429773	133769379	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	198572	2433732	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	2433850	3611140	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	3612364	8891313	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	8896190	9043090	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	9043719	39264026	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	39264096	39630562	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	39630709	56338009	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	56339088	56649785	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	56652157	70564025	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	70574714	72083500	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	72083635	102395912	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	102399478	102955738	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	102955810	116462819	1	1
TCGA-BR-7703-a	11	116465567	116557276	1	0
TCGA-BR-7703-a	11	116558690	135074876	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	51460	22712309	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	22713928	23141526	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	23145021	34701563	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	37463949	53550711	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	53554989	54241950	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	54244945	54554999	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	54558904	71153230	1	1
TCGA-BR-7703-a	12	71153950	88888440	1	0
TCGA-BR-7703-a	12	88889985	133201603	1	1
TCGA-BR-7703-a	13	18452809	64380022	1	1
TCGA-BR-7703-a	13	64387494	64467022	1	0
TCGA-BR-7703-a	13	64468531	67771152	1	1
TCGA-BR-7703-a	13	67777175	69101180	1	0
TCGA-BR-7703-a	13	69101571	114342922	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	18225647	28865245	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	28867311	29508365	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	29508753	40182940	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	40184044	40323396	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	40323957	86255473	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	86259738	87886322	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	87886966	97724067	1	1
TCGA-BR-7703-a	14	97725705	98241311	1	0
TCGA-BR-7703-a	14	98244318	106877229	1	1
TCGA-BR-7703-a	15	19811075	23837569	1	1
TCGA-BR-7703-a	15	23837586	27895986	1	0
TCGA-BR-7703-a	15	27896158	97693373	1	1
TCGA-BR-7703-a	15	97696796	98805398	1	0
TCGA-BR-7703-a	15	98805851	101928837	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	10777	31927134	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	31927270	63923164	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	63923428	75951673	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	75952454	77378377	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	77379367	78226217	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	78228924	78338714	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	78338949	78382944	1	1
TCGA-BR-7703-a	16	78383033	78554674	1	0
TCGA-BR-7703-a	16	78557656	90221127	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	150733	13529240	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	13531425	14042341	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	14042485	21153986	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	21161747	21425367	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	21427304	27541982	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	27542498	27889864	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	27894174	33731839	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	33733690	34470437	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	34472429	69637567	1	1
TCGA-BR-7703-a	17	69637899	69761363	1	0
TCGA-BR-7703-a	17	69761940	83090856	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	48133	3260115	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	3260602	3750642	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	3753093	10305923	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	10310037	10492826	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	10493080	22856911	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	22857039	24077410	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	24077747	53528395	1	1
TCGA-BR-7703-a	18	53528519	54372748	1	0
TCGA-BR-7703-a	18	54373144	80257174	1	1
TCGA-BR-7703-a	19	90910	58586487	1	1
TCGA-BR-7703-a	20	80664	40687126	1	1
TCGA-BR-7703-a	20	40696130	41141251	1	0
TCGA-BR-7703-a	20	41141335	64324800	1	1
TCGA-BR-7703-a	21	10336543	46677045	1	1
TCGA-BR-7703-a	22	15294545	35122131	1	1
TCGA-BR-7703-a	22	35124065	35814664	1	0
TCGA-BR-7703-a	22	35829407	50796027	1	1
TCGA-BR-7703-a	X	251810	741478	1	1
TCGA-BR-7703-a	X	765021	1420810	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	1420939	2543324	1	1
TCGA-BR-7703-a	X	2544095	2776199	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	2785350	3258451	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	3258486	44402763	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	44415768	44935723	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	44939893	78407808	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	78408931	78605421	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	78610990	105198084	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	105203221	105515169	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	105522083	149288077	1	0
TCGA-BR-7703-a	X	149293300	149411403	0	0
TCGA-BR-7703-a	X	149416041	156004181	1	0
